Polacy doskonale modelują białka

Konkurs organizowany jest przez Protein Structure Prediction Center w Kalifornii (USA), a zadaniem uczestników jest poszukiwanie algorytmów pozwalających przewidzieć strukturę przestrzenną białek na podstawie ich sekwencji aminokwasowych. Zawodnicy pracują nad kilkudziesięcioma białkami, których struktury przestrzenne zostały już poznane w wyniku prac doświadczalnych, ale nie zostały dotychczas nigdzie opublikowane. Zwycięzcami zostają te osoby, którym uda się za pomocą programów komputerowych prawidłowo określić strukturę największej liczby białek. Do 6 edycji konkursu zgłosiło się prawie 250 grup badawczych z całego świata, a polscy zwycięzcy to: prof. Andrzej Koliński z Wydziału Chemii UW, dr Krzysztof Ginalski z Interdyscyplinarnego Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego UW i BioInfoBank Institute oraz dr Janusz Bujnicki z Międzynarodowego Instytutu Biologii Molekularnej i Komórkowej.
Poznanie unikatowego kształtu białka jest niezbędne do określenia jego roli w organizmie i otwiera nieograniczone pole zastosowań praktycznych, m.in. umożliwia projektowanie nowych leków. Doświadczalne ustalanie struktury białek przy użyciu krystalografii lub magnetycznego rezonansu jądrowego jest czasochłonne i bardzo drogie. Zastosowanie w tym celu modelowania komputerowego wydaje się być metodą przyszłości.